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在秦王庄外城的军营大帐中，朱由检接见了解胜这一支秦兵中的大小头目。这些人都是部队中的骨干，但因为在名义上只是民团，他们的身份也都是团勇，因此并无职位，更无军阶的高低之分。
过去秦兵的兵力非常少，朱由检还顾不上考虑编制问题。现在秦兵的总兵力已经上万，而且还要进一步扩充。所以编制问题已经到了非解决不可的地步，否则就会直接影响战斗力。
在解决编制问题之前，朱由检也曾与孙传庭探讨过明军现有的编制。结果令他大失所望，因为现状就是一个字：乱！
从整体上看，明军分为边军和卫所两大体系。边军即是辽东、蓟州、宣府、大同、太原、延绥、宁夏、陕西、甘肃这九个边陲重镇，这里的军事长官是总兵官，简称总兵。
总兵责任重大，权力同样很大，可以根据战事需要，对麾下部属任意编制。九镇的编制各有不同，简直是随心所欲，可以说总兵基本上不能换，一换就要乱套。久而久之，就出现了像李成梁、祖大寿这样的半军阀。
而九边的边军即使奉诏赶赴同一战场作战，也是只听自己长官的命令，各打各的，根本谈不上什么协同。所以才会有满桂与祖大寿交恶的情况出现。除非最高长官“督师”出面，否则谁也不服谁。这样的部队，不被各个击破才怪！
而卫所截然不同于边军，可以看作是明军分驻各地的地方卫戍部队。按明初之制，凡州府必设一所，几个府合起来共设一卫，卫、所之间是上下级的统辖关系。卫设指挥使，统兵五千六百人；卫下有千户所，统兵一千一百二十人，长官是千户；千户所下有百户所，统兵一百一十二人，长官是百户。百户所之内，五十人为一总旗，一总旗下设五小旗，长官为旗长。
总的来说，卫所制就是按照辖地进行兵力的平均分配。这在兵种单一、作战手段简单的冷兵器时代以及和平年代，当然未尝不可。可现在已是乱世，一则军户制名存实亡，各卫所吃空饷现象十分严重，兵力普遍不到定额的四成；二则面对凶残的女真和蒙古骑兵，以及飘忽不定、来去如风的流贼，以卫所为单位的明军也明显力不从心。
除此之外，还有京师三大营，即所谓五军营、三千营和神机营，每营定员五万。在明朝开国之初，这本是马上皇帝朱元璋和朱棣的亲军，战斗力最为强悍。不过土木堡一战，三大营全军覆没，虽然后来重新组建，但逐渐不再承担野战任务，而转为京师的卫戍部队，战斗力直线下降。而且同样缺员严重，实际只有七八万人而已。
最后还有“亲军二十六卫”，像孝陵卫、锦衣卫、腾骧右卫、秦王卫等等都算。这些“卫”名为军队，实则并非执行作战任务，真上战场是不行的。
当然，因为流贼肆虐，官军应接不暇，又出现了“民军”，像秦兵、天雄军就是典型的例子。这些部队的建制就更加混乱，甚至根本没有建制。