自从卫国战争爆发以来，李晓峰和斯维尔德洛夫之间的分歧是越来越大，进入九月份之后，更是矛盾重重。
斯维尔德洛夫和托洛茨基认为可以在布列斯特一线打防御战，将德国人挡在白俄罗斯门外。李晓峰却认为打不得，主张大踏步的继续后退，撤到明斯克基辅一线再说。
斯维尔德洛夫和托洛茨基主张立刻同英美，至少是同英国结盟，组成反法西斯联盟。而李晓峰认为这个联盟暂时对苏联没有半点好处，英国人窝在英伦三岛半死不活，北非又被隆美尔干得一塌糊涂，还要死皮赖脸的找美国吃救济。
这时候跟英国结盟有啥好处？弄不好，好处没有，还得白送英国人一批重装备，谁让咱们是盟友呢？
相反，李晓峰认为，眼下这个状态挺好，敌人归敌人朋友归朋友，还是亲兄弟明算账，谁也别占谁的便宜。
不光是在军事和外交问题上双方分歧多多，在军工生产的问题上，双方的矛盾也比较突出。开战之后，斯维尔德洛夫不止一次派鲁祖塔克来做李晓峰的工作，希望某人做一做北方工业集团的工作，让北方工业将t35、t54和西科斯基直升机的技术无偿的向苏联的军工企业共享，最好还无偿的为苏联打工。
这个提议遭到了李晓峰断然拒绝，没有这样的搞法，北方工业又不是苏联的企业，而且在此之前，北方工业又没得到苏联一毛钱的好处。凭什么白送你技术和产品。就凭你脸大？
更何况。卫国战争爆发之后，北方工业还是给与了苏联政府相当的优惠条件，大幅下降了主要武器装备的价格，并且在结款方式给与变通，这已经算是够意思了。感情你觉得北方工业好欺负，这是准备打土豪分田地。
在北方工业的问题上，双方闹得很不愉快，算是不欢而散。而接下来在一些先进武器的研发项目上。双方也是龃龉不断。比如斯维尔德洛夫觉得克里莫夫和伊留申设计局正在进行的喷气式发动机研发项目完全可以暂时中止，反正一时半会儿这种看上去特别先进的发动机也派不上用场，何必浪费宝贵的军费？
不光是喷气式发动机项目，与此相关的试车台建设项目小斯也建议下马，还极大的不满意kgb内部的9294工程，认为这个工程吞噬了超乎想象的经费和资源，但是能看到的结果却是寥寥，也应该终止。
9294工程是什么？说直白一点就是由kgb秘密牵头的苏联原子弹工程，工程代号取自铀、钚的原子序数。该工程从1936年正式启动，在最初的几年里将苏联原子能方面的专家一扫而空。
为了维持该工程的正常运转。每年要吞噬掉kgb将近60%的经费。这么说吧，如果暂停该工程。苏联的军费开支将宽松很多。
截止到1941年，该工程才算是有了实质性的突破，建立了一座实验性质的石墨慢化反应堆，初步实现了受控制的链式反应。当然，要面临的问题还有很多，要想真正的将原子弹制造出来，还需要至少两年到三年的时间。
而现在，战争的形势相当的不好，吞噬了大量资源的9294工程就像一个无底洞，这让斯维尔德洛夫有些不能接受，他开始怀疑原子弹工程该不会只是一个大画饼，能看却不能吃。
“我坚决反对暂停9294工程，为了这个工程我们已经付出了五年的努力，也初步取得了进展，正式乘热打铁加大投入的时候，怎么能半途而废？”
李晓峰用很有煽动性的声调说道：“原子弹将是一种毁灭性的武器，如果我们今年就能拥有这种武器，那么我们在今年就能够结束战争。谁掌握了这种武器，谁就首先掌握了毁灭世界的能力。根据kgb的侦察，德国、美国正在以及即将开展相关的研究，所有有志于打赢这场战争的国家都极端地重视类似的研究。”
说到这，李晓峰忽然提高了声调：“这么说吧，在未来，如果没有几颗原子弹，我们在国际上说话都直不起腰！为了避免被帝国主义讹诈，我们必须尽快，或者说必须首先研制出这种武器！”
眼瞧着政治局对此并不是特别关心，李晓峰又一次提高了嗓门：“作为9294工程的负责人，我可以很负责任的向政治局保证，原子弹一定可以搞出来，而且一定能够为保卫苏联和世界无产阶级最广泛的利益发挥作用。三年，我只需要三年的时间，三年之后，没有原子弹，杀我的头，砍我的脑袋！”
托洛茨基、斯维尔德洛夫都目瞪口呆的望着某仙人，这可是立军令状，如果搞不出原子弹，虽然不至于真的砍某人的头，但某人的政治生命也肯定会被终结。
托洛茨基很是疑惑地问道：“原子弹真有那么大的作用？”
李晓峰重重地点点头，万分肯定地说道：“有，而且比我描述的作用更大，有了原子弹，掌握了核技术，这就意味着国际上的话语权！”
托洛茨基沉吟了片刻，然后说道：“我认为安德烈同志不会拿这个事情开玩笑，虽然我不了解也不太理解原子弹是个什么东西，但是我不反对苏联去搞一点这种武器！”
这就是托洛茨基和斯维尔德洛夫的不同了，有时候小斯显得太过于现实，太过精打细算，缺乏宏观的想象和预见能力。这也是他这一类最善于解决实际问题的干部的通病，他们更像是实干家，而不是导师。
而托洛茨基则不一样，他具备相当的解决实际问题的能力和手段。与此同时又不缺乏相关的想象力。这就导致在一些涉及到方向性的问题上。他看得比斯维尔德洛夫远。实事求是的说，在这方面的能力上，小斯还不如斯大林，钢铁可能还比他强一点。
托洛茨基表示支持，而李晓峰也愿意立军令状承担责任，9294工程这才惊险的被保留。当然，并不是所有的工程都像9294工程一样走运，比如海军的航空母舰工程（41型航母工程）就被冻结了。除了已经动工的两艘39型航母予以继续施工之外，已经完成图纸，并铺设了龙骨的41型航母被取消。
与此同时一并被取消的还有海军的40型重巡洋舰工程，作为35型重巡洋舰的改进型号，已经在船台上初具雏形的40型重巡被暂停，剩余的订货也全部取消。
与40型重巡一起被取消的还有39型火炮轻巡洋舰（36型轻巡的改进版）建造计划，除了已经开始舾装了两艘之外，全部被大刀阔斧的砍掉了。
整个战争期间，红海军算是受创最大的，主力舰项目基本被全部取消。能继续顺利开工的就是驱逐舰、潜艇和护卫舰，唯一保留的巡洋舰也是7000吨级的40型防空巡洋舰。不过建造数量和速度也被大大的放缓。
海军节省出来的资源和经费全部让给了陆军，在这场残酷的消耗战中，对于苏联来说陆军更加重要。
相对来说，空军受到的影响比较小，喷气式战斗机项目被保留，轰炸机中，叶2、sb2宣布停产而且中止发展改进型号，雅克12（历史上的雅克2/4系列）也被终止发展。图3和佩8予以继续生产和改进，与此同时，载弹量更大航程更远的远程轰炸机项目也得以开展。
战斗机中，唯一出局的就是米格1/3系列，被要求立刻停止生产，至于其改进型号米格7的命运，暂时未定，看上去是凶多吉少。